在一个阴雨绵绵的日子里，柯南、灰原哀和毛利小五郎等人受一位名叫藤井的企业家邀请，前往他位于郊区的豪华别墅参加一个聚会。藤井是毛利小五郎的一位老朋友，最近他的别墅附近发生了一系列奇怪的事件，让他感到十分不安，所以邀请小五郎前来帮忙调查。
当他们到达别墅时，发现别墅周围弥漫着一股压抑的气氛。别墅的管家带领他们进入客厅，藤井先生面色凝重地向他们讲述了事情的经过。原来，几天前的一个晚上，别墅的园丁在花园的角落发现了一具烧焦的尸体，警方虽然已经介入调查，但目前还没有任何头绪。
柯南和灰原哀立刻对现场进行了勘查。在焚尸的地点，他们发现了一些奇怪的痕迹，似乎是有人故意将尸体拖到这里进行焚烧的。而且，在尸体附近还找到了一些残留的布料碎片和一个奇怪的金属徽章。
灰原哀仔细研究了金属徽章，发现上面刻有一个神秘的标志，看起来像是某个组织的徽记。柯南则询问了别墅的工作人员和参加聚会的客人，得知最近藤井先生在生意上与一个竞争对手发生了激烈的冲突，那个竞争对手的公司标志与金属徽章上的标志有几分相似。
随着调查的深入，他们又发现了一些新的线索。在别墅的地下室里，有一间密室，密室的门被强行打开过，里面的一些重要文件也不翼而飞。柯南推测，这些文件可能与焚尸案有着密切的关系。
就在这时，别墅里突然传来了一声尖叫。他们赶到声音传来的地方，发现一名客人倒在地上，已经昏迷不醒。在他的身边，有一张纸条，上面写着：“这就是多管闲事的下场。”
柯南和灰原哀意识到，凶手就在别墅里，而且他还在继续作案。他们开始对别墅里的每个人进行仔细的调查，分析他们的行踪和动机。
在调查过程中，柯南发现藤井先生的女儿藤井美惠似乎对这件事情知道一些内情。她总是显得很紧张，眼神中透露出一丝恐惧。柯南和灰原哀找到了一个机会，单独与美惠谈话。在他们的追问下，美惠终于说出了真相。
原来，美惠与藤井先生的竞争对手公司的老板之子山本俊介相爱，但是两家的生意冲突让他们的爱情受到了阻碍。山本俊介为了让两家公司能够和解，偷了公司的一些机密