入研究，找到了一种可以抑制其活性的能量波频率。联合舰队迅速行动，利用搭载特殊能量波发射装置的战舰，对受影响的恒星进行治疗。随着能量波的发射，“噬星菌”的活性逐渐受到抑制，恒星的异常闪烁现象得到缓解，开始恢复正常的能量辐射。
而对于空间不稳定问题，科研团队发现是因为在宇宙深处存在一个巨大的“空间能量漩涡”。这个漩涡不断吸收和扭曲周围的空间能量，导致周边区域的空间出现异常。他们提出了一个大胆的设想，通过在空间漩涡周围布置一系列特殊的能量节点，利用这些节点产生的反向能量流来抵消漩涡的吸引力，从而稳定空间。联合组织迅速组织力量制造和部署这些能量节点，经过紧张的施工和调试，空间扭曲程度开始逐渐减轻，星际航线也逐步恢复正常。
然而，就在联合组织和各文明为这些来之不易的成果感到欣喜时，新的危机却如暴风雨般突然降临。从神秘舰队逃窜的方向，一股强大的能量风暴正迅速向联合组织控制的星域袭来。这股能量风暴的强度远超以往任何已知的宇宙现象，所过之处，星际尘埃被瞬间汽化，小型行星也被强大的能量潮汐撕成碎片。
同时，联合组织收到了来自多个星系的紧急报告，一种新型的机械生命体开始在这些星系中肆虐。这些机械生命体外形类似昆虫，具有高度的适应性和攻击性，能够迅速拆解和同化各种物质，将其转化为自身的能量和结构材料。它们所到之处，城市被摧毁，文明设施化为废墟，居民们纷纷逃离家园。
联合组织再次面临严峻考验，刚刚看到的曙光瞬间被新的危机阴云所遮蔽。是集中力量应对能量风暴，还是先解决机械生命体的威胁？如何在这双重危机下保护各星系的文明？联合组织必须迅速做出决策，带领各文明在这场新的危机中寻找生机，宇宙的命运再次悬于一线。