以正名视听，号令四方。”
石宝、厉天闰、邓元觉等大将纷纷附和。“是啊，圣公，如今我军士气正盛，江南百姓多有归附，正是创建大业的时机，建立政权，方能让天下人知晓我们的志向。”麾下众将的声音此起彼伏。
方腊听着麾下众将的话语，心中暗自欢喜，表面上却装作犹豫的样子说道：“此事重大，容我再斟酌斟酌。”可实际上他的内心早已下定了决心，要建立政权称帝。
几日之后，方腊留下一员大将镇守润州，自己和几个大将率领义军主力返回杭州。
抵达杭州后，在麾下众将的劝说下，方腊正式建立摩尼教政权，定都杭州，随后开始对手下将领论功行赏，并对麾下四方大将进行分封。
王寅被封为尚书右丞相兼镇国大都督，与方腊一同坐镇杭州府，辅助方腊统筹各项军政事务。
方腊的侄子方杰，武艺高强，被封为护国大元帅。方腊命他带兵前去征伐江宁府的残余朝廷军队，力求将这股势力彻底清除。
石宝获封南离大将军，邓元觉被尊为护国法师兼护国元帅。方腊令这两位猛将率义军征讨江南东路，期望能在这片地区站稳脚跟，扩大势力。
厉天闰和司行方分别被封为镇国大将军、护国大将军。二人领命率领义军北上，进攻淮南东路，试图在江北地区开辟新的局面。
此外，庞万春、吕师囊等其他将领也都得到分封。方腊派遣他们带领部分义军南下，攻打福建路，进一步拓展势力范围。
各路大将遵从方腊的命令，率领义军以两浙路为中心，向周围江南其余各路发起了攻伐。
一时间，整个江南风云变幻，起义军的攻势如同潮水一般。江南各路的守军根本无力抵抗，纷纷溃败或者弃城而逃。整个江南大部分地区都陷入了战火之中。
驻守在江宁府内的监军杨戬以及江南各路的官员，在听闻方腊称帝的消息之后，均面色惨白。需知，百姓反叛，若不称帝，尚且能够予以招安或者安抚，可一旦称帝，性质就全然变为不死不休了。
杨戬内心慌乱至极，将方腊称帝的事宜写成奏折，经八百里加急送往京师。然而没过几日，又听闻方腊兵分多路，江南各路纷纷被其麾下大将攻占。