，他将辅公祏任命为仆射，地位虽高于左右将军，但兵权却没了。
辅公祏为此十分不满，干脆说自己要和好友左游仙去修道，离开了权力中心。
之后，杜伏威入长安，安排曾背着他逃过一劫的义子王雄诞接管兵权，辅公祏接管政务，还让王雄诞监视辅公祏。
辅公祏怒了，于是伪造杜伏威的信件，责备王雄诞有异心。
王雄诞中计，十分郁闷，干脆就蹲在家里，也不管军务了。
辅公祏趁机接掌兵权后，派人来劝降王雄诞，王雄诞反应过来，后悔不已，但大势已去也没了办法，但是他坚决拒绝和辅公祏一起造反，说：
天下这才刚刚平定，而且吴王还在长安。大唐的军队天下无敌，你造反就是想灭族，最多风光一百天，到时候必定败亡。
因为王雄诞坚决不肯追随辅公祏，便被辅公祏杀害。
李渊知道后，非常痛心，又有感于王雄诞的忠义，让他的儿子王世果承袭了他的郡公爵位，最高官职安西大都护！（从二品）
之后，辅公祏宣称杜伏威在长安受到欺负，借机反叛，自立为帝，国号为宋。
第二年624年，辅公祏被李孝恭和李靖击败，被斩首！
而杜伏威也是被辅公祏给坑惨了，本来在长安待得好好的，却因为辅公祏造反被牵连。
史料记载：武德七年（624年）三月二十一日，暴毙！
墓志铭则记载是因为辅公祏的反叛，导致他忧惧而死。
《新唐书》记载，他因为喜好服长生药，中云母毒而死。
不过，有学者认为，中毒或许是真的，但是中什么毒，那就不一定了，或许李渊当了一次绝命毒师也不一定。
毕竟，云母本身几乎是无毒的。
当然也有可能是云母不纯净，含有其他有毒杂质，又或者那“长生药”不止有云母，可能还有其他什么不知道的有毒药材也说不定。
毕竟历史上被各种“仙丹”给弄死的人，那也是不计其数。
自此，隋末农民大起义，算是彻底的完结！】
“啊？你，我”
隋炀帝时空，江淮杜伏威和辅公祏互相十分尴尬的对视了一眼。