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大规模的对外扩张导致马莱与世界各国交恶，由于过度倚赖巨人之力，军事科技逐渐落后给其他国家。在与中东联合的战争中，因主要战场都在海上，巨人无法在海上使用，使用老旧舰艇的马莱海军，舰队损失大半，有艾尔迪亚战士队协助的陆军也只是惨胜。此战过后，马莱帝国军决定不再倚赖巨人之力，并且争取时间全力发展军事科技。
在854年在收容所遭到调查兵团袭击后之后，马莱军就被迅速部署到市区，协助马莱治安局维持秩序并撤离幸存者。然而，因为人数上的差距以及巨人之力等问题最终遭到了毁灭性的打击，调查兵团也将这些可怜的走卒当作炮灰去测试包括新型武器雷枪以及炸药包在内的各种武器的实战能力。指挥部除了马加特与科斯洛在内的少部分成员之外，投入到拯救任务之中的队员几乎全军覆没。
在雷贝利欧收容区之战中惨败给调查兵团，军队高层亦遭全灭，因此由马加特掌握军权，并且开始改革逐渐腐朽的马莱帝国军。战后号召世界各国合组世界联合军，准备对帕拉迪岛展开焦土作战。
在莱纳的提议下，没有等待世界联合军集结完成就先一步对帕拉迪岛展开突击，意图阻止地鸣。但艾伦在死前最后一刻发动地鸣，大部分的马莱军人也被吉克操纵的无垢巨人所杀，残余的马莱军队乘坐飞艇逃回马莱，马莱战士和马加特则留在帕拉迪岛，为了阻止地鸣与调查兵团结盟。
在130话中马莱海军与世界联合舰队在大陆近海列队向泳渡过海的超大型巨人开炮意图阻止其登陆。最终遭到超大型巨人歼灭。
马莱陆军阻止超大型巨人登陆马莱东北海岸失败，马莱军民开始溃逃，马莱大陆已被超大型巨人摧毁大半。
133话中马莱大陆也已被消灭。马莱空军残存部队动用所有的兴登堡号飞艇对始祖巨人实行轰炸。
马莱军主要使用第一次世界大战中的武器与装备。艾尔迪亚士兵穿着黑色作战靴，浅褐色作战服，每人身上挂着子弹带。所有小队和指挥官佩戴有布洛迪钢盔，作战服佩戴部队臂章。头盔侧面印有部队徽章。在进行生化作战时所有部队配带盒子防毒面具（自吸式长管呼吸器又称贮气式防毒长管面具）部队总司令与副官携带k ii型号望远镜（n